Zbog današnjih izmijenjenih ekoloških uvjeta, šume se nalaze pod različitim pritiscima koji utječu na njihovo uspijevanje. Shodno tome, u Zavodu za ekologiju šuma provode se znanstvena istraživanja i stručne aktivnosti u cilju utvrđivanja izvora stresa i mogućnosti prilagodbe šumskih vrsta drveća novim uvjetima. Poseban naglasak se daje na istraživanja u području ishrane šumskog drveća (utjecaj klimatskih parametara i onečišćenja), pedologije (zakiseljavanje tala, teške kovine) i hidropedologije (kvaliteta i razine procjednih i podzemnih voda), depozicije (unos atmosferskih onečišćenja u odnosu na kritične vrijednosti), flornog sastava i bioraznolikosti (indikatori stanišnih promjena), te modeliranja i analize prostornih podataka.
Svi uzorci okoliša analiziraju se u vlastitom laboratoriju za fizikalno-kemijska istraživanja (LFKI). U Zavodu za ekologiju šuma znanstvena istraživanja neodvojiva su od motrenja (monitoringa), jer iskustvo HŠI u području motrenja šumskih ekosustava na europskoj razini kroz sudjelovanje u Međunarodnom programu za procjenu i motrenje utjecaja zračnog onečišćenja na šume (UNECE – ICP Forests) i moderan laboratorij imaju značajan utjecaj na kvalitetu znanstvenog rada u Zavodu.
Glavne djelatnosti Zavoda za ekologiju šuma obuhvaćaju sljedeće poslove:
PROJEKTI